13 521
правка
Изменения
м
=== Предварительный вывод ===
Для любой из предположенных выше задач необходимы предобработанные данные, то есть то, что мы, позаимствовав GEO-терминологию, назвали DataSet’ом. Я предполагаю следующие действия: критически оценив имеющиеся подходы к предобработке данных (ссылки на книги высылаю по почте), расписать процесс перехода от DataSeries к DataSet (это, по-моему, наиболее важно). На основе этого реализовать некий модуль, который бы из таблиц сырых данных давал нам сравнимые между экспериментами данные по каждому гену. Не исключаю, что нас вполне могло бы устроить то, что реализовано, например, в Bioconductor; но все же необходима ревизия того, какие именно методы корректны для обработки таких данных.
[[Участник:VitaliyFilippov|VitaliyFilippov]] 18:31, 12 марта 2010 (UTC) Хотелось бы внести ясность. В терминологии GEO «DataSet» — не что иное, как просто набор данных. Нет у них никакого общепринятого понятия о предобработке и том, какие результаты она должна давать. Есть ли у вас какие-то понятия о «предобработке»? У меня нет никаких, кроме робкого предположения о том, что это, наверное, сравнительная эксперессия генов в ''каком-то'' виде. В ''каком'' виде — пока что без понятия. Кстати, рекомендую всем прочитать [[Справка:Рекомендации|рекомендации по работе с MediaWiki]], их там чуть-чуть.
→Предварительный вывод
Далее нужны тестовые реальные данные, для которых будет ясен верный ответ, и в случае неудовлетворительной работы алгоритма сравнения изменения экспрессии — его можно будет корректировать или выбрать другой. Критерием завершения (Definition Of Done) можно считать корректный результат для большинства этих данных.
== Форматы ==